在土家族地区，直到现在，依然流传着很多关于土家医药的动人故事和美丽传说。在土家族的历史上，由于没有文字记载，很多医学知识，除了通过“口口相授”和“代代丰富”外，还有很大一部分是通过这种故亊传说的方式在民间广为流传。虽然只是故亊和传说，但对于医学知识的传承和发展也起到了很重要的作用。

民间流传着药王菩萨为民治病，最后骑白虎登天成佛的传说。传说中药王经常外出寻找药物为百姓治病，一日，药王菩萨路过河边，看见岩板上有一滴滴的鲜血，便问旁人何故，旁人曰：“刚死一产妇，出葬从这里路过。”药王听后大惊，曰：“世人不善医药而误人致死，惨也。”他追上送葬之人，见坑已挖好，产妇尚未下葬，便对他们讲：“此妇人未死，为何葬之？”众人皆惊，便问药王：“何以知其未死？”药王回答说:“人死则血止而发黑，今见沿途滴血不绝，故可知其未死。”家人听后，便请药王诊治。药王速取针一根，深刺一穴，少顷，妇人叹息一声，再少顷，妇人少腹蠕动，产下一子，而得救两人性命。又一日，药王到山中采药，尝后中毒倒在一蔸茶树下昏死过去。次晨，茶树叶卜.露水滴入药王口中，药王便慢慢苏醒，于是便知茶叶有解毒之功。后来，茶能解药性，吃药不能喝茶水的说法，一直流传至今，妇孺皆知。再一日，药王路过一山，一只白虎突然跑到他面前，张着口。药王大惊，说：“我一辈子为民治病，没做亏心事。今天你要吃我，请点头三下。若不吃我，请摇头三下。”老虎听后，便摇头三下，双目流泪，似有乞求解难之意。药王便大胆走近老虎身边，见老虎被一大块猪骨头卡住喉咙，药王便用药速将猪骨头从虎口中取出。老虎仍然不走，横身靠近药王，此时药王便明虎意，于是骑上虎背，白虎腾空而去，药王便同白虎一道升天成佛（部分土家族人民崇拜白虎，以之为图腾）。为了纪念药王，明朝时期，在沅水河畔的泸溪县浦市修建了“药王庙”，庙中香火连年不断，祈祷药王菩萨保佑庶民，直到新中国成立初期，绵延440多年。据记载庙里还挂了一面铜镜，传说这面铜镜是药王菩萨留下为民诊疗疾病的，可以照见人体全部血脉，药物走向。

民间还传说上天太上老君见民间疾苦，便派弟子下凡为民治病。弟子说:“徒儿不懂医药，怎能解除凡人的疾苦呢？”于是太上老君给弟子仙丹三粒，口服后便浑身透明。接着又封赠弟子随便扯到草即是治病的药，这就是后来百草都是药，百草能治病的来由。这些关于土家族医药的民间故事，虽然是传说，但千百年来，土家族人民仍世代不忘药下菩萨、太上老君弟子为他们治百病，拯救苍生的恩惠。有的土家山寨对医术精湛、深孚众望的老药匠（土家族对医生的尊称）称之为药王菩萨或太上老君弟子下凡，即来源于此。

在鄂西南土家族民间有关上药的传说也较多。如在《党参的来历》中记载，古鄂西南一带流行着一种怪病，症见脉虚，气短，四肢无力，不死不活，十分痛苦。一位姓党的土家医受仙人点化，找到一种植物，治好了这种病,后将这种药物取名党参。

土家族民间流行的民歌民谣中有关土家药的内容也较多。如《采山草》中云：“五月初五去看郎，郎被毒蛇一口伤；胸口不见一口气，灵芝一朵人还阳。”土家医对一些急救药物称之为“还阳”。在鄂西南湘西北土家族民间还阳药物较多，称为“七十二还阳”，是多种急救药物的泛称。《神医》中云：“仙山采得仙药来，治得百病都断根；身上化脓烂了眼，四半叶子草铜钱；喉痛眼迷尿不通，清热解毐鱼腥草；身上长疱和长疔，熬服膏药贴上面；遇上大灾和大病，去问寨里老神医；毒蛇咬伤有良药，饭后残水调熬用；心口绞痛用磁针，外配汤药一两服。”

这些流传在民间的故事和传说，既使很多土家医的用药诊疗经验得以传承，又表达了土家人民对药匠的尊敬。